Ingénieur d'études biologiste en traitement de données F/H

Au cœur de l'Oncopole de Toulouse, le CRCT, avec tous ses partenaires (institutionnels, universitaires, cliniques, industriels, caritatifs…), stimule l'innovation en termes de recherche et d'enseignement dans la lutte contre le cancer.
Le CRCT conduit une approche intégrée entre la recherche, les soins et l'enseignement, dans une logique transversale et multidisciplinaire. Il accueille 18 équipes de recherche très performantes et huit installations centrales regroupées au sein d'un centre technologique.
Dans un cadre de recherche clinique sur la résistance aux thérapies, nous recherchons un(e) bioinformaticien(ne) pour assurer le traitement et l'analyse des données de séquençage ADN circulant et ARN.
MISSIONS PRINCIPALES :
Traitement des données (Pipeline) : Mise en œuvre et optimisation de pipelines de traitement (QC, alignement, quantification), appel de variants
Analyse de l'expression différentielle : Identification des gènes différentiellement exprimés
Identification de signatures moléculaires de l'adaptation ou la résistance tumorale
Analyse fonctionnelle : Interprétation des signatures (Gene Ontology, GSEA, Pathways, etc.)
Visualisation : Création de figures pour publication (Heatmaps, Volcano plots, PCA, etc.)
Gestion de données : Organisation des fichiers et archivage des résultats
CDD de 9 mois, non renouvelable - temps plein - 38h30
REMUNERATION : À partir de 2421,65€ brut mensuel en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent.
Emploi-Type
A2A41 - Ingénieur-e biologiste en traitement de données
Pour en savoir +
· Sur l'Inserm : https://www.inserm.fr/ ; site RH : https://rh.inserm.fr/Pages/default.aspx
· Sur la politique handicap de l'Inserm et sur la mise en place d'aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap : ***

APTITUDES :
Rigueur méthodologique
Esprit de synthèse
Capacité à travailler en autonomie
EXPERIENCES SOUHAITEES :
Une expérience en analyse RNAseq sera appréciée
Une expérience sur environnement Linux/Unix (ligne de commande) sera appréciée
Une expérience avec un ordonnanceur (Slurm) sera appréciée

L'Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l'ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l'innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.
Rejoindre l'Inserm, c'est intégrer un institut engagé pour la parité et l'égalité professionnelle, la diversité et l'accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l'Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.
L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.