Ingénieur-e biologiste en traitement de données F/H

Au cœur de l'Oncopole de Toulouse, le CRCT, avec tous ses partenaires (institutionnels, universitaires, cliniques, industriels, caritatifs…), stimule l'innovation en termes de recherche et d'enseignement dans la lutte contre le cancer.
Le CRCT conduit une approche intégrée entre la recherche, les soins et l'enseignement, dans une logique transversale et multidisciplinaire. Il accueille 18 équipes de recherche très performantes et huit installations centrales regroupées au sein d'un centre technologique.
La personne recrutée au sein de l'équipe Network Biology for Immuno-oncology " NetB(IO)² " aura pour mission de collaborer à l'analyse de plusieurs ensembles de données disponibles dans l'équipe, en particulier à l'analyse des données de transcriptomique obtenus à partir d'expériences de co-culture cellulaire pour la création de simulations de ces systèmes sur ordinateur, en utilisant les logiciels existants et en développant de nouveaux outils si nécessaire.
Catégorie : A
Corps : Ingénieur d'Etudes
Emploi-type : A2A41 : Ingénieur-e en traitement de données
Rémunération : A partir de 2.421,65€ brut mensuel, en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent
Pour en savoir plus :
Sur l'Inserm : https://www.inserm.fr/ ; site RH : https://rh.inserm.fr/Pages/default.aspx
Sur la politique handicap de l'Inserm et sur la mise en place d'aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap : ***

Activités principales :
Activités à la paillasse sur un système de co-culture de cellules in vitro
Développement de codes pour la transcriptomique, l'analyse de données omiques
Développement de modèles mathématique pour la simulation de ces culture in silico
L'équipe NetB(IO)² "est composée de plusieurs post-doctorants et doctorants ayant une formation mixte en biologie ou en sciences quantitatives, ainsi que d'un autre bio-informaticien, et d'un groupe indépendant de biologistes travaillant sur des expériences en laboratoire.
La personne recrutée va travailler en particulier sur une co-culture des cellules cancéreuse dans un microenvironnement tumoral.
Connaissances :
Expérience en co-culture des cellules humaines
Maîtrise du phénotypage cellulaire par FACS
Connaissances théoriques en immunologie
Expérience en analyses de données RNAseq
Utilisation d'outils bio-informatiques et travail en laboratoire de bio-informatique
Expérience avec le logiciel PhysiCell pour la simulation des modèles individu-centrés (agent based) d'interaction cellulaire
Compétences en science des données et statistiques
Utilisation de systèmes d'exploitation basés sur Unix
Maîtrise des langages R, python, shell scripting, avec une capacité à apprendre d'autres langages de programmation
Expérience avec Github et le versioning
Savoir-faire :
Savoir synthétiser les résultats de recherche sur un document PowerPoint et le présenter à ses collègues
Garantir la qualité et la pertinence des outils d'analyse et des résultats
Excellentes aptitudes à la communication, orale et écrite en Anglais, à l'organisation et à la gestion de projets
Aptitudes :
Capacité à travailler de manière autonome tout en s'intégrant pleinement dans une équipe pluridisciplinaire
Savoir accueillir et intégrer les retours pour ajuster ses pratiques professionnelles et garantir une progression constante
Faire preuve de solidarité et partage d'expertise en apportant un soutien aux autres collègues en cas de besoin
Prioriser et planifier efficacement son travail pour respecter les échéances
Faire preuve de rigueur
Esprit d'initiative
Niveau de diplôme et formation(s) : M2 bio-informatique / biologie
Avantages :
32 jours de Congés Annuels et 13 jours de RTT
Mutuelle santé collective obligatoire MGEN avec participation de l'employeur à hauteur de 50% pour le socle de base et à hauteur de 50% dans la limite de 5€ pour les options
Prévoyance collective facultative avec participation de l'employeur à hauteur de 7€ pour le socle de base
Restauration collective subventionnée sur place
Comité d'action sociale (prestations sociales, culturelles, sportives)
Transports publics remboursés à 75%
Forfait mobilité durable

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